研究効率化 Pythonで論文情報をまとめてゲットする⑥～EFetchを使ってアブストラクトを抽出～
論文情報をまとめて取るシリーズの最新版です。今回はEFetchを用いて、アブストラクトを取ってこようと思います。これまでの記事の内容が理解できていることを前提としたいと思います。これまでの記事はこちら● Pythonで論文情報をまとめてゲッ...
論文情報取得自動化
研究効率化 
研究効率化 Pythonで論文情報をまとめてゲットする⑤ ~ Openpyxlを使ってExcelファイルとして保存する ~
今回はこれまでにゲットした情報をExcelに保存したいと思います。前回の記事でSummariesというオブジェクトを作成し、そこに論文情報(PMID, Title, Author, Journal, Pubdate)を格納しました。Summ...
未分類 Pythonで論文情報をまとめてゲットする④ ~ ESummaryを使って論文タイトルを取得 ~
PythonでPubmedから論文情報を取得するシリーズの続きです。今回はESummaryを使って論文のタイトル等の情報をゲットしていきます。前回までに検索で該当する論文のPMIDを取得できました。これまでの記事はこちらESummaryにつ...
未分類 Pythonで論文情報をまとめてゲットする③ ~ ESearchを使ってPMIDを取得 ~
前回までにPythonを使った論文情報取得のための準備が完了しました。今回は実際にPythonを使って論文検索し、HitするPMIDを取得したいと思います。まだ準備ができていない場合はこちらで説明しています。ESearchについてEntre...
未分類 Pythonで論文情報をまとめてゲットする② ~ 下準備 ~
今回はPythonでPubmed APIを使うための準備編です。Pubmed APIについては前回の記事で軽く書きました。ここからはPythonがPCにインストール済みであることを前提で進めていきます。まだの方はまずはこちらからPython...
未分類 Pythonで論文情報をまとめてゲットする① ~ PubMed APIについて ~
研究生活の効率化の一つとして、論文調査がありますよね。それをボタン一つでまとめる方法を細かく連載していきたいと思います。一から説明していきますので、長く、くどくなるかもしれませんが笑だけど、終わったときには論文調査だけでなく、Pythonの...